中国物理学会主办刊物推荐的6篇论文获得第三届中国科协期刊优秀学术论文奖。它们分别是《Chinese Physics》推荐的"Structure and superconductivity of Mg(B1-xCx)2 compounds"(作者:张绍英等6人)、《大学物理》推荐的"爱因斯坦对光子的想象--辐射与分子间能量动量转移的动平衡"(作者:彭桓武)、《高能物理与核物理》推荐的"Determination of Ψ(2S)Total Number by Inclusive Hadronic Decay"(作者:莫晓虎等5人)、《化学物理学报》推荐的"用交叉分子束研究氟原子与反式1,3--丁二烯分子的反应"(作者:顾全力等6人)、《物理学报》推荐的"谐衍射双波段红外超光谱探测系统研究"(作者:孙强等5人)以及《物理学进展》推荐的"量子理论若干基本问题研究的新进展"(作者:孙昌璞)。
  2006年2月23日,在中国科技会堂举行了颁奖大会。